《迷途猫OVER RUN》围绕着主人公雾谷希展开。雾谷希经营着一家名为“甜点工房 斯特拉”的蛋糕店，他原本平静的生活因几只“迷途猫”的到来而发生改变。美少女芹泽文乃因家庭原因离家出走，来到希的店里打工，她性格傲娇，却有着不为人知的温柔一面。还有外表可爱但内心坚强的保登心爱，以及神秘的香椎爱莉也陆续加入到店里。在经营蛋糕店的过程中，他们遭遇了各种有趣又麻烦的事情，比如制作新蛋糕时的创意难题、应对竞争对手的挑战等。同时，几人之间也产生了许多温馨又搞笑的互动，有误会、有和解，在这个过程中大家的感情也越来越深厚，共同谱写出一段充满欢笑与感动的青春故事。