《双峰第二季》延续第一季的神秘风格，故事围绕着双峰镇展开。在劳拉·帕尔默谋杀案调查的基础上，新的谜团不断涌现。联邦调查局特工戴尔·库珀继续追查真相，却陷入越来越复杂的局面。他遭遇了各种奇异事件和神秘人物，如来自另一个世界的「巨人」不断给出隐晦提示。镇民们的生活也因案件的持续发酵而发生巨变，人际关系变得更加错综复杂。安妮的出现让库珀的感情生活泛起涟漪，而利兰被鲍勃附身的情况愈发严重，最终酿成更多悲剧。随着剧情推进，真相似乎近在咫尺，却又遥不可及，整个双峰镇笼罩在更加浓厚的悬疑氛围中。