《我和我的时光少年》围绕着少女林惜和学霸彭派展开。林惜因父亲工作变动转学到新学校，在这里结识了彭派等一众好友。起初，林惜和彭派因为一些小误会产生了摩擦，两人互看不顺眼。但在后续的校园生活中，他们一起经历了各种事情。在学习上，彭派帮助偏科的林惜提升成绩，两人在这个过程中逐渐对彼此有了新的认识。他们还共同参与校园活动，一起面对来自老师、家长的压力和同学间的竞争。随着时间推移，林惜和彭派的感情悄然发生变化，从互相嫌弃到彼此欣赏。同时，他们与身边的朋友也一起度过了许多难忘的时光，有欢笑也有泪水，共同书写了一段充满青春回忆的故事。