一艘货船在海上遭遇神秘生物袭击，残骸被军方发现。海洋生物学家尼姆丝和同事在现场调查，发现了巨大脚印和奇怪的蛋。原来，这是受到核辐射变异的哥斯拉，它来到纽约寻找适合产卵的地方。哥斯拉在纽约大肆破坏，造成了极大的混乱和恐慌。尼姆丝和记者埃迪等人试图追踪哥斯拉，了解它的行踪和习性。军方则制定了一系列计划，试图消灭哥斯拉。在激烈的战斗中，哥斯拉虽然强大，但最终还是被军方设计引入陷阱，受到重创。而它留下的蛋也被消灭，纽约暂时恢复了平静。