《妖怪旅馆营业中第二季》延续前作，围绕着半妖少女佐伯葵展开。佐伯葵继承了祖母经营的妖怪旅馆，在这一充满奇幻色彩的世界里继续着她的营业日常。旅馆中依旧住着形形色色的妖怪，有傲娇的狐妖、憨厚的熊妖等。本季里，旅馆迎来了新的挑战，比如神秘妖怪势力企图抢夺旅馆的土地。佐伯葵和旅馆的妖怪伙伴们团结一心，共同应对危机。他们在解决问题的过程中，也增进了彼此的感情。同时，佐伯葵自身的半妖能力也在不断成长，她逐渐学会更好地运用能力帮助妖怪们，在妖怪世界中赢得了更多的尊重和信任，续写着妖怪旅馆的精彩故事。