《X 战警：黑凤凰》故事发生在 20 世纪 80 年代，琴·格雷在一次太空救援任务中被神秘能量击中，从而获得了强大且难以控制的力量。这股力量让琴逐渐被黑暗侵蚀，她的情绪变得极不稳定，时而温柔善良，时而暴躁易怒。X 战警团队内部因此产生了巨大的分歧，万磁王想利用琴的力量达成自己的目的，而X教授则试图保护琴并帮助她掌控能力。随着琴的力量不断失控，她引发了一系列灾难性事件，纽约陷入混乱，X 战警们也面临着前所未有的危机。最终，为了拯救世界，琴不得不做出艰难的抉择，她选择牺牲自己，平息了这场由她引发的风暴。