《超时空要塞Macross》的故事始于 1999 年，一艘来历不明的巨大外星战舰坠落地球，人类将其命名为 SDF-1 超时空要塞号，并展开研究。主角一条辉原本是一名热爱飞行的青年，误打误撞进入了超时空要塞号。在与外星种族天顶星人的战斗中，一条辉逐渐成长为一名优秀的飞行员。他结识了歌星林明美，林明美的歌声不仅抚慰人心，还在关键时刻发挥了特殊作用，成为对抗天顶星人的秘密武器。随着剧情发展，一条辉在爱情上陷入林明美与女战士早濑未沙之间的纠葛。同时，人类与天顶星人从最初的激烈战斗，到后来逐渐相互理解，最终携手对抗共同的敌人，实现了种族间的和解与和平。