《铳皇无尽的法夫纳》故事围绕着主人公如月隼人展开。在这个世界里，被称为“龙”的怪物频繁出现，对人类造成巨大威胁。而拥有特殊能力、能与龙对抗的少女们被集中到了私立圣翔学园。如月隼人因特殊原因转学到这里，他是世上最后一个男性人类。学园里的少女们各有特点，比如傲娇的立华深雪、温柔的葛城美九等。隼人在学园中与少女们共同生活，一边要应对龙的袭击，一边还要处理与少女们之间复杂的情感纠葛。在一次次与龙的战斗中，隼人和少女们不断成长，他们之间的羁绊也愈发深厚，共同为守护人类的未来而战。