《黑色太阳》聚焦于侵华日军 731 部队的罪恶行径。影片中，731 部队以活人作为实验对象，进行着惨无人道的细菌实验、毒气实验等。部队长石井四郎为了所谓的“研究成果”，全然不顾人类的生命和尊严。无辜的百姓被抓进这个人间炼狱，遭受着非人的折磨。有人被注射病菌后痛苦地死去，有人在毒气室中绝望挣扎。随着剧情推进，展现了正义力量对 731 部队罪行的调查和揭露。最终，这些恶魔般的战犯受到了应有的审判，让观众看到了正义的伸张，也深刻了解到那段黑暗历史中日军的残暴与罪恶。