《假面骑士BLACK RX》承接《假面骑士BLACK》剧情，主角南光太郎在与邪恶组织戈尔戈姆的战斗中，因戈尔戈姆的改造实验而获得了假面骑士的力量。在戈尔戈姆被消灭后，新的邪恶组织克莱西斯帝国出现，他们妄图征服世界。南光太郎在战斗中被克莱西斯帝国抓住并再次改造，却意外觉醒成为了假面骑士BLACK RX。 RX拥有众多强大的技能和形态，如超级1号形态、泰坦形态、飞鹰形态等，每种形态都有独特的能力。在旅途中，他结识了许多伙伴，一起对抗克莱西斯帝国的阴谋。他们不仅要面对克莱西斯帝国的各种怪人，还要解开帝国背后隐藏的巨大秘密。南光太郎凭借着坚定的信念和强大的力量，一次次在危机中拯救世界，最终成功击败克莱西斯帝国，守护了和平。