《间谍家族》围绕着特工“黄昏”展开。为完成秘密任务，他需要组建一个家庭并让孩子进入名校伊甸学园。于是，他收养了读心术超能力者阿尼亚，又与杀手约尔组成假夫妻。阿尼亚在学校里状况不断，因读心术知晓“黄昏”的间谍身份，还想帮他完成任务。约尔虽外表优雅，实际是个武力值爆表且常迷糊的杀手。在一次学校活动中，阿尼亚为了获得星星努力表现，却意外引发一系列搞笑事件。一家人在充满危机与搞笑的日常中，彼此的羁绊逐渐加深，共同演绎出一段温馨又刺激的故事。