《机动战士高达SEED HD重制》以未来世界为背景，人类向宇宙移民并建立了殖民卫星，由此分为了自然人和新人类。基拉·大和本是奥布的普通学生，因好友阿斯兰·萨拉所属的扎夫特军袭击奥布，他被迫登上大天使号，驾驶高达参战。在战斗中，基拉不断成长，也陷入了友情与立场的挣扎，他与阿斯兰这对昔日好友在战场上兵戎相见。同时，拉克丝·克莱茵为了阻止战争，与基拉等人一起为和平而努力。剧中有着激烈的高达对战场面，如基拉驾驶的强袭高达与阿斯兰驾驶的圣盾高达的对决。各方势力为了资源、理念展开了一场又一场惊心动魄的战斗，而主角们在战火中坚守着自己的信念，为了和平不断抗争。