《美丽的他》围绕着清居奏和平良一成展开。平良一成是个极度自卑、不善社交的少年，在高中入学仪式上，他偶然看到了作为学生代表发言的清居奏。清居奏外表出众、气质不凡，宛如发光体，平良瞬间被其深深吸引。此后，平良总是默默关注着清居，而清居也注意到了这个总是偷偷看自己的男孩。随着相处，清居开始主动接近平良，两人的关系逐渐变得微妙。他们一起经历了许多事情，平良在清居的影响下慢慢变得自信，清居也在平良的陪伴中感受到了别样的温暖。在这个过程中，两人之间萌生出了爱情，他们小心翼翼又热烈地爱着彼此，共同谱写了一段纯美动人的恋爱故事。