《男子游泳部第一季》围绕着水着少年们的青春故事展开。主人公七濑遥曾是小学游泳接力赛的成员，与松冈凛、橘真琴、叶月渚一同创造过辉煌。然而，凛转去澳大利亚后，接力队解散。高中时，遥和真琴、渚重逢，三人加入了濒临废部的游泳部。此时，凛回国，他在澳大利亚接受了高强度训练，实力大增，性格也变得有些骄傲。凛向遥发起挑战，想证明自己更强。在一次次的比赛和训练中，遥等人不断成长，他们不仅提升了游泳技能，还加深了彼此的友谊。游泳部也在他们的努力下逐渐有了活力，吸引了新成员龙崎怜的加入。大家一起为了参加全国大赛而拼搏，在这个过程中，有欢笑、有泪水，更有对梦想的执着追求。