《Rewrite第二季》延续了前作的奇幻风格，故事围绕天王寺瑚太朗展开。在这个世界里，存在着拥有特殊能力的“星之守”，他们守护着世界的平衡。第二季中，瑚太朗所在的风祭学院面临着新的危机，神秘组织不断制造麻烦，企图打破现有的秩序。 与此同时，瑚太朗与伙伴们的感情也在经历考验。他和千里、朱音等女孩之间的羁绊愈发深厚，在共同应对危机的过程中，他们的能力不断成长。而在剧情推进中，隐藏在世界背后的真相逐渐浮出水面，原来一切的危机都与一个古老的秘密有关。众人必须团结一心，解开谜团，才能拯救世界，他们在冒险中不断成长，为了守护重要的人而奋力战斗。