《我的朋友很少第二季》延续了第一季的故事，围绕着由羽濑川小鹰、三日月夜空等人组成的邻人社展开。邻人部依旧是大家交流互动的重要场所，成员们在这里继续着充满欢笑与烦恼的日常生活。小鹰努力协调着社团成员之间的关系，同时也在处理自己与夜空、星奈等女孩之间微妙的情感。星奈依旧活泼可爱，以自己的方式表达着对小鹰的好感；夜空表面傲娇，内心却十分在意小鹰。社团还迎来了新成员，为故事增添了新的元素和冲突。他们一起举办活动、解决问题，在这个过程中，彼此的友谊逐渐加深，也有了更多关于友情、爱情的感悟。