《我们无法一起学习第二季》延续了第一季的故事，以高中学生们的学习与恋爱生活为主题。男主角唯我成幸为了实现恩师的嘱托，帮助三位成绩不佳但各有天赋的女生考上理想大学。其中，傲娇才女古桥文乃一心想进入文学部，却在学习上有所偏科；运动少女桐须真冬渴望成为声优，学习基础较为薄弱；天才少女绪方理珠虽然聪明但缺乏学习动力，目标是进入科学研究领域。在辅导过程中，成幸与她们的关系愈发亲密，各种搞笑又温馨的故事不断上演。他们一起面对学习的压力、友情的考验和爱情的萌芽，在相互扶持中共同成长，第二季进一步展现了他们复杂又有趣的青春故事。