《舞武器舞乱伎 星之巨人》的故事发生在一个名为“星之巨人”的学园都市。在这里，学生们会使用被称为“舞武器”的特殊武器进行战斗。主人公苍叶莲太郎是一个平凡少年，却意外被卷入了学园都市的纷争中。他结识了拥有强大舞武器的少女们，如性格傲娇的神乐坂诗织、温柔善良的白鸟姬香等。他们一边要应对学园都市中各种心怀不轨的势力，一边还要解开舞武器背后隐藏的秘密。在一次次激烈的战斗中，莲太郎与少女们的羁绊逐渐加深，他们共同成长，为了守护学园都市和彼此的信念而战，在充满热血与激情的战斗中书写着属于他们的青春传奇。