《西藏秘密》以西藏和平解放前后为历史背景，围绕着扎西顿珠、仁钦噶伦、多吉次仁等人物展开。扎西顿珠本是贵族子弟，却因家族变故沦为奴隶，后又成为喇嘛。他在复杂的政治环境和宗教斗争中不断挣扎。仁钦噶伦作为旧贵族势力代表，妄图维护旧制度，与新生的进步力量产生激烈冲突。多吉次仁则是进步青年，积极推动西藏的变革。剧中既有扎西顿珠与白玛之间真挚动人的爱情故事，又有各方势力为了权力、信仰和利益的明争暗斗。随着剧情发展，西藏和平解放的大势不可阻挡，旧制度逐渐瓦解，新的生活和希望在这片土地上生根发芽。