《新女巡按》围绕着女扮男装的谢瑶环展开。谢瑶环本是深得皇帝信任的宫廷女官，因皇帝微服出巡时遭遇危险，她临危受命，被封为女巡按，前往江南彻查官员贪污舞弊、草菅人命等案件。 在江南，谢瑶环遇到了诸多棘手的状况。她与当地的黑恶势力、腐败官员斗智斗勇。期间，她结识了书生唐小南，两人在相处中渐生情愫。同时，她还和武功高强的剑平成为好友，剑平一路协助她破案。 然而，谢瑶环的查案之路并非一帆风顺。她不断遭到反派的陷害和阻挠，但凭借着自己的智慧和勇气，一次次化险为夷，成功揪出了幕后黑手，还百姓一个公道。最终，谢瑶环完成使命，也收获了属于自己的爱情。