《虚构推理》围绕着少女岩永琴子和青年樱川九郎展开。岩永琴子 11 岁时被妖怪们掳走，成为它们的“智慧之神”，负责为它们解决各种难题，为此还失去了一眼一足。樱川九郎则拥有能令妖怪们都畏惧的特殊体质。两人相遇后，琴子对九郎一见钟情。 故事中，出现了各种超自然事件和神秘妖怪。比如钢人七濑的都市传说，七濑本是偶像，意外死亡后却以幽灵形象出现，还引发了一系列伤人事件。琴子为了平息这一事件，运用自己的智慧，通过虚构出合理的故事来引导大众的认知，让人们相信钢人七濑只是虚构的存在。在这个过程中，琴子展现出了过人的逻辑推理能力和应变能力，与九郎一起应对各种挑战，在充满奇幻色彩的世界里，上演了一场场精彩的推理对决。