《越狱第五季》故事接续前作，主角迈克尔被认为已死，但林肯却收到他还活着的消息。原来迈克尔被囚禁在也门的也门监狱，林肯、斯科菲尔德家族及旧友组成救援小队前往营救。在越狱过程中，他们遭遇重重困难，不仅要应对监狱里凶狠的守卫和复杂的环境，还要躲避也门当地势力的追捕。同时，新反派卡姆·费尔南德斯登场，他与迈克尔等人展开激烈对抗。迈克尔等人一边越狱，一边揭开背后更大的阴谋，涉及政治黑幕与秘密组织。最终，迈克尔成功越狱，与家人团聚，也将幕后黑手绳之以法，正义得以伸张。