《终物语》围绕着高中生阿良良木历展开。故事分为上下两部，上部中，阿良良木历的妹妹火怜和月火遭遇了怪异事件。火怜因过度的正义感，身体出现了异常，月火也陷入了某种困境。阿良良木历为了解救妹妹们，与忍野扇等角色一起探寻真相，在这个过程中，他不断回忆起过去与各种怪异战斗的经历，也逐渐揭开了忍野扇背后隐藏的秘密。下部则聚焦于阿良良木历与战场原黑仪的感情发展以及他们面临的新挑战。战场原黑仪遭遇了来自家庭等方面的压力，阿良良木历始终陪伴在她身边，两人在共同面对困难的过程中，感情更加深厚，同时也对彼此有了更深的理解。