《最近，妹妹的样子有点怪》围绕高中生神前美月和她的哥哥神前郁哉展开。美月原本是个普通女孩，却因父亲再婚，迎来了新妈妈和她的女儿神前小零。然而一场意外，美月被恶灵附身，为了不伤害哥哥，她努力隐藏自己的变化。小零则拥有特殊能力，知晓美月被附身一事，开始帮助她。在相处过程中，郁哉逐渐察觉到美月的异样，却不知真相。随着故事发展，美月在恶灵影响下做出许多奇怪举动，家庭氛围也变得微妙。几人在面对恶灵的过程中，彼此的感情逐渐加深，共同经历了一系列搞笑又温馨的故事，也在困难中不断成长。