《密查》以1938年日本侵华时期为背景，围绕着“宣侠父失踪案”展开。西安督查处调查员武仲明临危受命，负责调查此案。武仲明心思缜密、智勇双全，在调查过程中，他遭遇重重阻碍与危险。国民党、共产党、日本特务等多方势力相互交织，各自心怀鬼胎。国民党内部有人妄图掩盖真相，日本特务则想借此制造混乱。武仲明不仅要与狡猾的敌人斗智斗勇，还要应对来自上级的压力和猜疑。同时，他与地下党员蒋宝珍产生了情感纠葛，两人在复杂的局势中相互扶持。随着调查的深入，真相逐渐浮出水面，武仲明也在这场惊心动魄的斗争中坚守着正义与信仰。