《诸神之怒》承接前作，主角珀修斯本已回归平凡生活，却因诸神的纷争被卷入新的危机。哈迪斯告知他，克洛诺斯正冲破囚禁，一旦成功，世界将陷入毁灭。为拯救人类与诸神，珀修斯不得不再次踏上冒险之旅。他与海神之子阿基纳、半人半神埃洛斯等组成队伍，一同前往冥界。在途中，他们遭遇了各种恐怖的怪物和艰难险阻。在与克洛诺斯的最终对决中，珀修斯凭借勇气和智慧，联合诸神之力，最终战胜了克洛诺斯，拯救了世界，也让诸神重新恢复了对人类的信心。