《小逃亡者》故事围绕着小男孩佩皮展开。佩皮以为自己意外打死了哥哥，内心充满恐惧与自责，于是决定离家逃亡。他带着简单的行囊，踏上了前往科尼岛的旅程。在逃亡途中，佩皮经历了许多新鲜又刺激的事情。他在海边结识了一群同样天真烂漫的孩子，和他们一起玩耍、冒险。在这个过程中，佩皮逐渐忘却了内心的恐惧，尽情享受着自由的时光。然而，他的家人并没有放弃寻找他。最终，家人找到了佩皮，而这时大家才发现，哥哥并没有死。佩皮在这场特别的“逃亡”中，完成了一次心灵的成长。