《火星异种2016》故事设定在人类为了使火星变得适合人类居住，在火星投放了藻类和以藻类为食的昆虫“火星蟑螂”。然而这些蟑螂发生了变异，体型巨大且拥有高智商，对人类构成了威胁。地球派遣了15名身怀绝技的男女前往火星执行歼灭任务。主角小町小吉是其中一员，他和队友们在火星遭遇了各种危机。他们不仅要面对凶猛残暴的火星异种，还要应对队友之间的矛盾与分歧。在战斗中，不断有队友牺牲，小町小吉等人逐渐成长，他们凭借着顽强的意志和出色的战斗能力，一次次化险为夷，与火星异种展开了一场惊心动魄的生死对决。