《黄飞鸿之男儿当自强》故事发生在清末民初，列强入侵，国家动荡不安。黄飞鸿（李连杰饰）本在广州经营宝芝林，却被卷入一场政治斗争与民族危机的漩涡。白莲教徒在外国势力的挑唆下，盲目排外，四处破坏教堂。黄飞鸿起初对革命党人孙文（张铁林饰）的理念并不理解，但在经历一系列事件后，他逐渐意识到救国不能只靠武术，更需要新思想。 期间，黄飞鸿结识了革命志士陆皓东（甄子丹饰），两人惺惺相惜。然而，陆皓东不幸牺牲，这让黄飞鸿深受触动。他开始支持孙文的革命事业，与白莲教、外国侵略者展开了激烈的斗争。最终，黄飞鸿在一场惊心动魄的大战中，凭借高强的武艺和坚定的信念，击败了敌人，也明白了“男儿当自强”不仅是个人的强大，更是民族的觉醒与自强。