电影《妖怪比留子》围绕叶村让和神秘美少女剑崎比留子展开。叶村让加入了灵异现象社团，社团收到了来自班目机构研究设施的调查委托。他们一行人来到了被称为“魔眼之匣”的地方，这里与世隔绝。然而，恐怖的事情接踵而至，他们遭遇了丧尸般的怪物袭击，被困在了这个危险之地。比留子展现出了冷静和智慧，与叶村让一起努力求生。在不断的探索和战斗中，他们逐渐揭开了班目机构背后的秘密，也发现了妖怪传说与现实之间的惊人联系。在绝境中，他们能否找到生存的方法，解开谜团并成功逃脱，成为了影片的一大看点。