《珍爱泉源》的故事跨越了千年时空，涉及三个不同的时代。在古代玛雅，探险家汤米为了拯救身患绝症的皇后伊莎贝尔，踏上寻找生命之树的艰难旅程，他穿越丛林、挑战重重危险，只为获取能治愈皇后的神奇力量。现代，科学家汤米同样在为拯救患脑癌的妻子伊莎贝尔而努力，他全身心投入科研，试图从一颗神秘的古树上找到治疗方法，在实验室里日夜钻研，承受着巨大的压力和希望的煎熬。而在未来，汤米化作一颗包裹在透明气泡中的树人，带着伊莎贝尔的意识穿越宇宙，飞向象征永恒生命的星辰。影片通过这三个相互交织又各自独立的故事，深刻探讨了生命、爱情与死亡的主题，展现了人类对永恒和救赎的不懈追求。