高中生四月一日君寻天生拥有强大灵力，能看见妖怪。这特殊能力给他带来诸多困扰，妖怪常纠缠他，正常生活被严重影响。一次偶然机会，他闯入侑子小姐经营的神秘商店。侑子告知他，要消除身上的灵异现象，就必须付出相应代价来交换解决办法。从此，四月一日开始在商店打工偿还代价。在这期间，他经历了各种离奇灵异事件，结识了九轩葵、百目鬼静等朋友。他们一起面对妖怪、诅咒和神秘力量，在解决事件的过程中，四月一日逐渐成长，也慢慢理解了侑子所说的“代价”的真正含义，同时也揭开了自己身世的神秘面纱。