《镖人动画版》以隋朝为背景展开故事。主角刀马是一名身手不凡的镖人，带着儿子阿育娅行走江湖，以护送他人为生。在一次护送任务中，他们卷入了各方势力的纷争。朝廷鹰犬、江湖帮派等都在为各自的利益明争暗斗。刀马凭借着自己的武艺和智慧，一次次化解危机。他性格洒脱不羁，重情重义，面对敌人毫不畏惧。阿育娅虽年纪尚小，但勇敢聪慧，也在经历中不断成长。他们在旅途中结识了形形色色的人物，有善良正义的同伴，也有阴险狡诈的对手。每一次相遇都伴随着新的故事和挑战，他们在这乱世中不断前行，书写着属于自己的传奇。