《心跳漏一拍第二季》延续第一季的甜蜜，聚焦尼克和查理的校园恋爱故事。尼克努力适应自己的性取向，查理则在这段感情中愈发投入。新学期，两人面临着新挑战，比如如何在学校公开关系，应对外界异样眼光。同时，他们的朋友群体也有新故事。塔拉和达西的感情遭遇信任危机，艾萨克在友情与爱情间迷茫。学校组织的法国之行成为重要情节，旅途中大家增进感情，也暴露矛盾。尼克和查理在异国他乡感情升温，却也因误会产生短暂隔阂。最终，众人在经历波折后，更加珍惜彼此，尼克和查理坚定携手，朋友间情谊也更加深厚。