《青春期猪头少年不做怀梦少女的梦剧场版》围绕着梓川咲太与樱岛麻衣等人展开。咲太的妹妹梓川枫因青春期综合征陷入沉睡，为了唤醒她，咲太四处奔走。在这个过程中，他遭遇了诸多离奇事件。樱岛麻衣也面临着自身的困境，她的存在似乎逐渐被世界遗忘。咲太与麻衣相互扶持，共同对抗着青春期综合征带来的种种难题。他们穿梭于不同的时空与记忆之间，试图找到解决问题的关键。在追寻真相的道路上，咲太不断成长，也更加坚定了守护身边人的决心。最终，在众人的努力下，他们能否打破困境，让一切回归正轨，令人期待。