《四月一日灵异事件簿剧场版：仲夏夜之梦》围绕着拥有灵异能力的高中生四月一日君寻展开。四月一日能看见妖怪，生活因此充满困扰，直到他偶然闯入侑子小姐经营的次元商店。在那里，他以工作为代价换取摆脱灵异困扰的方法。此次剧场版中，正值暑假，四月一日在商店帮忙时，周围开始发生一系列奇异事件。神秘的梦境不断侵扰他，梦中出现的神秘少女似乎与现实有着千丝万缕的联系。随着调查深入，四月一日发现这一切与古老的妖怪传说有关。他和侑子小姐、百目鬼、九轩葵等人一同解开谜团，在这个过程中，四月一日对自己的能力和在商店的意义有了更深的认识，也经历了一场奇幻又充满温情的仲夏夜之梦。