《黑客帝国动画版》由 9 部短片组成，将《黑客帝国》的世界观进一步拓展。在“机器的复兴”中，人类与机器爆发战争，人类为切断机器能源遮蔽天空，却促使机器开发出利用人类生物电能的技术，人类沦为电池，被囚禁在虚拟世界“矩阵”。“少年故事”里，少年戴尼在虚拟世界拥有超能力，能改变物理规则，这引起了特工注意，他在导师指引下明白自身处境，最终选择进入真实世界。“侦探故事”中，私家侦探巴托调查神秘失踪案，逐渐发现矩阵背后的秘密，还与锡安城产生联系。这些短片从不同角度展现了人类与机器的对抗、虚拟与现实的交织，呈现出一个充满想象力和深度的科幻世界。