《别当欧尼酱了！》围绕着男主角绪山真寻展开。原本是家里蹲的尼特族男性，某天一觉醒来却发现自己变成了美少女。这一突如其来的转变让真寻陷入了巨大的混乱之中。他不仅要适应身体上的变化，还要面对来自妹妹绪山美波里的好奇与监督。美波里对变成女生的哥哥充满了兴趣，时不时就会做出一些让真寻害羞不已的举动。在学校里，真寻以女生的身份开始了全新的生活，结识了神乐坂冬马、白石丽等同学。神乐坂冬马是个假小子，白石丽则是个有点天然呆的女孩。真寻在努力保守自己秘密的同时，也在这个过程中逐渐成长，经历了一系列搞笑又温馨的故事。