《闪乱神乐第一季》围绕着一群身怀绝技的少女忍者展开。主角飞鸟是一名普通女高中生，却意外被神乐学园录取，这所学校专门培养忍者。在学园里，飞鸟结识了众多性格各异的伙伴，如活泼开朗的斑鸠、傲娇的葛城等。她们一边要应对学校的忍者课程训练，一边还要面对各种危机。邪恶组织“暗之蛇”时常出来搞破坏，企图征服世界。飞鸟等人组成的忍者小队，凭借着各自独特的忍术和武器，与“暗之蛇”展开了一场又一场激烈战斗。在战斗过程中，少女们不断成长，彼此之间的友情也愈发深厚，她们在欢笑与泪水中共同守护着和平与正义。