《圣保罗炮艇》以1964年巴西军事政变这一特殊历史时期为背景。影片聚焦于圣保罗号炮艇上的一群士兵，他们原本只是普通的军人，却被卷入到复杂的政治漩涡之中。炮艇上的士兵们面临着忠诚与良知的艰难抉择，一方面是上级下达的命令，另一方面是内心对于正义和真相的追求。在政变的混乱局势下，炮艇成为了各方势力争夺的关键力量。士兵们在执行任务的过程中，逐渐发现了政变背后隐藏的阴谋和黑暗交易。他们开始反抗不合理的命令，试图揭露真相，在这个过程中，他们遭遇了来自各方的阻挠和危险，但依然坚定地为了正义而战。