《我的仙尊女友》围绕着平凡青年林羽展开，他本过着普通的生活，一次偶然机会，结识了拥有强大仙尊身份却意外流落人间的苏瑶。苏瑶因渡劫失败失去部分法力，只能暂居林羽家中。林羽善良地帮助苏瑶隐藏身份，两人在朝夕相处中情愫暗生。然而，仙界得知苏瑶下凡且法力受损的消息，派出使者要将她带回。林羽为了和苏瑶在一起，决定跟随她前往仙界。在仙界，他们面临着重重考验和阴谋，苏瑶的旧敌也趁机发难。但林羽和苏瑶相互扶持，凭借着彼此的爱和勇气，一次次化解危机，最终不但稳固了苏瑶的仙尊之位，两人也修成正果。