《大清十二刑》以清末为背景，讲述了捕快陈最峰的故事。陈最峰因误判案件，导致无辜者死亡，内心愧疚不已。此时，京城发生了一系列离奇命案，死者皆遭受大清十二刑中的刑罚而死。陈最峰临危受命，与搭档一同展开调查。在查案过程中，他们遭遇重重困难，不仅要面对神秘凶手的狡诈，还要应对官场的黑暗与各方势力的阻挠。随着调查深入，他们逐渐发现案件背后隐藏着一个巨大的阴谋，涉及到朝廷的机密和一些权贵的利益。陈最峰坚守正义，不顾自身安危，最终揭开真相，将凶手绳之以法，也救赎了自己的灵魂。