《奇门偃甲师》的故事围绕着神秘的奇门偃甲术展开。主人公作为一名奇门偃甲师，身怀操控机关偃甲的绝技。在一个被邪恶势力笼罩的世界里，邪恶势力妄图利用奇门偃甲术的力量来达成自己的野心，他们四处抢夺偃甲秘术，所到之处生灵涂炭。主人公不忍看到百姓受苦，毅然踏上了阻止邪恶势力的征程。 一路上，他结识了志同道合的伙伴，有擅长医术的少女，能在战斗中救助伤员；还有精通奇门遁甲之术的老者，为他们出谋划策。他们共同面对重重困难，破解了一个又一个机关陷阱。在与邪恶势力的最终对决中，主人公凭借着对奇门偃甲术的深刻理解和伙伴们的帮助，成功击败了邪恶势力，拯救了世界，让和平重新降临。