《侍神令》故事发生在人妖共生的世界，阴阳师晴明（陈坤 饰）却发现自己是人妖混血。他在京都与百旎（周迅 饰）相遇，百旎是他的式神，二人一同守护着阴阳寮。然而，妖皇势力蠢蠢欲动，试图打破人妖两界的平衡。妖皇派妖灵袭击人类，引发恐慌。晴明在调查中结识了慈沐（陈伟霆 饰），慈沐表面正义，实则与妖皇勾结，企图利用晴明的力量达成自己的野心。在不断的战斗与追寻真相过程中，晴明逐渐揭开自己身世的秘密。最终，晴明与百旎等伙伴一起对抗妖皇和慈沐，历经艰难，成功守护了人妖两界的和平。