《毒枭矮子第三季》延续前作剧情，聚焦墨西哥大毒枭华金·古斯曼·洛埃拉，也就是“矮子”的故事。这一季中，矮子虽身陷囹圄，但他在监狱里仍凭借强大的势力和手段，遥控着毒品生意的运作。他利用监狱工作人员的腐败，与外界保持联系，继续指挥着毒品的生产和运输。与此同时，美国缉毒局和墨西哥警方加大了对他的打击力度，试图彻底摧毁他的贩毒帝国。他们深入调查，不放过任何线索，与矮子及其手下展开了一场惊心动魄的猫鼠游戏。在这个过程中，双方都使出浑身解数，各种激烈的交锋不断上演。矮子的家人和手下也在为他的自由和贩毒事业四处奔走，他们与执法人员之间的矛盾冲突愈发尖锐，剧情紧张刺激，充满了悬念与反转。