在神海岛流传着关于海底沉睡的古代遗迹“海底宫殿”和 300 年前两名女海盗安·宝妮和玛莉·瑞德遗留的宝藏传说。柯南、小兰、园子等人来到神海岛度假，参加了当地举办的寻宝活动。活动中，他们结识了一群宝藏猎人。然而，危险也悄然降临，宝藏猎人们一个接一个地遭遇不测。在调查过程中，柯南发现这些案件与传说中的宝藏有着千丝万缕的联系。同时，小兰和园子被困在了一个即将被海水淹没的洞穴中。柯南凭借着自己的智慧和推理能力，不仅解开了宝藏的秘密，还找到了凶手，并成功救出了小兰和园子，让神海岛恢复了往日的平静。