《少女卧底第二季》中，女主角查丽依旧以高中生的身份作为掩护，执行各种危险的卧底任务。在新一季里，她面临着更为复杂的案件和更强大的对手。查丽和搭档博迪继续在校园与秘密任务之间切换，一边要应对学校里的同学关系、学业压力，一边要完成特工组织交付的重任。 有一次，他们要潜入一个神秘犯罪组织的拍卖会，阻止珍贵文物被非法交易。查丽巧妙地伪装成富家千金混入其中，在危机四伏的环境中收集情报。而博迪则在外面配合，随时准备支援。过程中，查丽险些暴露身份，但凭借着机智和勇敢化险为夷。此外，查丽在学校还遇到了感情上的小困扰，她与同学之间的关系也因为卧底身份变得微妙起来。这一季充满了刺激的冒险、精彩的动作场面和青春的小插曲。