《少女杀手阿墨2》延续前作，阿墨依旧在危险的杀手世界中挣扎。故事开场，阿墨陷入了新的危机，敌对势力对她展开疯狂追杀。她一边要躲避敌人的围堵，一边还要解开背后隐藏的阴谋。在逃亡过程中，阿墨结识了一些新伙伴，他们有的是为了正义，有的是为了利益，共同踏上了冒险之旅。然而，伙伴中也隐藏着背叛者，给阿墨带来了意想不到的打击。随着剧情推进，阿墨逐渐揭开真相，原来一切都与一个神秘组织有关。最终，阿墨凭借着自己的智慧和超强的战斗能力，与神秘组织展开了一场惊心动魄的决战，为自己和身边的人讨回了公道。