《战斗之魂：少年突破马神》围绕少年马神展开。马神是个热爱战斗之魂卡片对战的少年，他怀揣着成为顶尖决斗者的梦想。在战斗之魂的世界里，人们通过卡片召唤出各种强大的灵魂生物进行战斗。马神在不断的对战中结识了许多志同道合的伙伴，如性格开朗的龙丸等。他们一起参加各种比赛，面对来自不同地区的强劲对手。在一次重要的全国大赛中，马神遭遇了实力强劲且心术不正的对手，对方为了胜利不择手段。但马神凭借着对战斗之魂的热爱和坚定信念，以及与伙伴们的默契配合，一次次突破自我，最终战胜强敌，在战斗之魂的世界里留下了属于自己的传奇。