影片中，狄仁杰携护卫李元芳奉命调查大理寺丢失官银一案。他们在调查途中意外卷入神秘组织的阴谋，被诬陷为盗银凶手，被迫逃亡。在逃亡过程中，二人深入龙隐迷窟。此窟内机关重重、危机四伏，还有神秘怪兽出没。他们一边躲避官兵追捕，一边探寻真相。狄仁杰凭借过人的智慧和推理能力，抽丝剥茧，逐渐揭开神秘组织妄图颠覆朝廷的惊天阴谋。最终，狄仁杰和李元芳在龙隐迷窟与神秘组织展开生死对决，成功阻止阴谋，洗清自身冤屈。